台湾地区“中研院”院长廖俊智任期2026年6月届满，依规定今年年底“院长遴选委员会”必须向评议会提出候选人至少四人。廖俊智11月13日赴台民意机构进行业务报告，国民党民代柯志恩质询时指出，传出台湾地区前领导人蔡英文副手陈建仁是四名候选人之一。而他原本是“委员会”的副召集人，还参加了8月举办的两场座谈会，向同仁搜集对院长的建议，却在9月底请辞。柯志恩认为，陈建仁此举是“裁判变球员”，提前知道面试题目，对其他三名候选人非常不公平。

“遴选委员会”发言人陈仪庄回应称，现阶段无法告知陈建仁是否为院长候选人。更称不必担心公平问题，因为所有会向院长候选人提出的问题，都是事后才决定的，而且8月座谈会的资料也是公开的。

柯志恩则指出，这是个程序问题，如果四名候选人中有一名是前副召集人，8月时便看过所有同仁，也了解同仁对台“中研院”的期许，就会比其他三名候选人具备更多的竞争力。如果陈建仁是候选人，就应该在刚被征询时立刻辞去副召集人的角色，而不是在9月底才辞去，这对其他候选人非常不公平。